Cuenta la leyenda que hace dos mil años, en la antigua América Central, tuvo lugar una gran batalla entre dos grandes guardianes; Totec, el Guardián de la Luz, y Xolotl, el Guardián de las Tinieblas. Xolotl utilizó elEspejo De Humo con el que liberó a unas aberrantes criaturas las cuáles acabaron con el ejército de Totec. El Guardián de la Luz sobrevivió a la batalla, y juró encontrar una manera de derrotar al Guardián de las Tinieblas. Para ello, logró encerrar a Xolotl en el Espejo de Humo, pero tuvo que sacrificarse y convertirse en una estatua de piedra para vigilarlo por el resto de la eternidad.

En la actualidad, año 2010, Lara Croft intenta encontrar el paradero del supuesto “Espejo De Humo”.
Después de un largo y peligroso viaje que supera con éxito, encuentra el dichoso espejo en un templo, sin embargo, es tomada por sorpresa por una banda de mercenarios que actúan bajo las ordenes del Señor de la Guerra, los cuáles la habían seguido hasta el templo.   El Señor de la Guerra le arrebata a Lara el espejo desconociendo totalmente cuál es su poder. Su imprudente manejo del espejo libera al guardián Xolotl. La estatua de piedra de Totec cobra vida y advierte a Lara que Xolotl debe ser detenido antes de que salga el primer rayo del amanecer.

Dependiendo del número de jugadores que participan, Lara y Totec o bien se unen o van por caminos separados para tratar de detener a Xolotl.